Reiki har sin oprindelse i tibetansk buddhisme. Gennem følgende legende er Reiki blevet genindført i vore dage i USA og resten af verden.

I midten af 1800 tallet var Mr. Mikao Usui forstander og leder af den kristelige skole ved Doshisah Universitetet i Kyoto, Japan. Hans elever spurgte ham hvorfor Jesus kunne helbrede og andre som fulgte ham ikke kunne ? Dette spørgsmål tog han til sig som en personlig udfordring. Han blev fritaget for sine forpligtelser på universitet og derefter begav han sig ud på en rejse for at finde svaret. Efterforskningen begyndte han på Chicago Universitet, hvor han ligeledes fik sin doktorgrad i kristelig teologi. I de kristelige skrifter kunne han ikke finde svaret.

I sin søgen på svaret ledte Mr. Mikao Usui videre i de gamle kinesiske hellige skrifter samt han berejste muligvis også rundt i det nordlige Indien. I slutningen af sin søgen vendte han tilbage til Japan, hvor han opdagede nogle gamle symboler i de buddhistiske sutras og disse let forståelige læresætninger på sanskrift, indeholdte nogle af de svar han ledte efter. Herefter rejste han til det hellige bjerg KURIYAMA, lige udenfor byen Kyoto. Mens han vendte sig i østlig retning udlagde han 21 sten og efterfølgende begyndte en tid med meditation og bøn. Mr. Mikao Usui tog hver dag en sten op og bad Gud om en åbenbaring og forståelse af sanskrift-symbolerne i de buddhistiske sutras.

Den sidste dag af fastetiden bad Mr. Mikao Usui til Gud om at få svar på sin bøn. Som et lyn fra en klar himmel så han en lysstråle komme imod ham og eksplodere på ham. Lysstrålen ramte ham lige midt i panden og slog ham bevidstløs. Lige i øjeblikket følte han det, som om han var død. Noget tid efter så han en million bobler i alle regnbuens farver. Herefter så han sanskrift-symboler dukke op foran sine øjne i guld. Tiden for Usui-metoden for naturlig helbredelse, som vi kender som Reiki, var begyndt.

Endvidere fortsætter legenden med, at Mr. Mikao Usui opdagede at han havde evnen til at helbrede folk, da kom ned fra bjerget. Dem han underviste var forundrede over at han evnen til at lette deres smerter. Og alle dem han havde hjulpet, følte hvor varme hans hænder blev når han rørte ved dem.

Mr. Mikao Usui rejste ned til klosteret i Kyoto, hvor han fandt biskoppen sengeliggende med mange smerter. Hans fortalte biskoppen om sine oplevelser på bjerget mens han havde placeret sine hænder på hans hofter og den nedre del af ryggen. Da de havde talt sammen i et stykke tid, erklærede biskoppen, at hans smerter var forsvundet. Herefter forklarede Mr. Mikao Usui ham, at var Reiki, som havde været i glemmebogen i så lang tid, der havde lettet hans smerter.

Senere begav Mr. Mikao Usui sig til Kyotos slum kvarter for at hjælpe og heale de fattige tigger. Han til bragte 7 år i Kyotos slum kvarter, hvor han behandlede og healede de syge.

Han lagde mærke til at nogle af de samme mennesker han havde healede kom igen og igen. Her blev han klar over at disse mennesker havde valgt at tigge, og at de anså verden for at være for besværlig at leve i – ”en verden, der krævede for meget selvdisciplin”. Mr. Mikao Usui indså ved denne lejlighed, at Reiki skulle forandres, hvor efter han udgav Reiki’s fem grundlæggende principper, som er:

1.- I dag vil jeg være taknemmelig;
2.- I dag vil jeg undlade at bekymre mig;
3.- I dag vil jeg undlade at være vred;
4.- I dag vil jeg være ærlig over for mig selv;
5. - I dag vil jeg udtrykke kærlighed og respekt for alt levende.

 Mr. Mikao Usui rejste rundt i Japan for at praktisere Reiki. Han modtog 18 elever, på sine rejser fra Hokkaido i nord til de sydlige provinser, der rejste med ham. Mr. Mikao Usui videregav en Reiki Grand Masters indsigt til Chujiro Hayashi, da han lavede sin endelige overgang på denne jord.
Chujiro Hayashi blev læge og byggede en Reiki klinik i Kyoto, Japan.

I 1931 kom Fru Hawayo Takata fra Hawaii til Japan for at få hjælp til en alvorlig sygdom. Hun opsøgte Chujiro Hayashi, der healede hende med Reiki og hun blev rask.
Før Chujiro Hayashi død videregav han sin viden til Fru Hawayo Takata, der blev hans efterfølger, som Reiki Grand Masters. I mange år underviste og praktiserede Fru Hawayo Takata Reiki. Før hun døde i 1980 havde hun uddannet 22 Reiki masters i USA og Japan. Fru Hawayo Takata’s barnebarn Phyllis Furomoto, blev valgt som hendes efterfølger. Den dag i dag findes der organisationer, som nedstammer fra denne oprindelige gruppe af Reiki lære.